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反硝化深床濾池脫氮的影響因素有以下幾點：
1、碳源投加
反硝化菌多數屬于異養、兼性厭氧細菌，一般認為 BOD5 / TN 約在 3 ～ 5 時，不需要投加碳源，而以好氧反硝化菌為優勢菌種的系統 C/ N 更高。 污水處理廠尤其經過二級處理的水質碳源含量低，而硝酸鹽氮與亞硝酸鹽氮去除效率低，使得后續深度處理碳源不足。 在反硝化深床濾池應用實踐中有投加乙酸鈉、甲醇、葡萄糖等，根據進水水質中 C/ N 含量進行適量投加，能促進反硝化菌的培養，強化反硝化脫氮功能。 東港污水處理廠反硝化濾池調試時對乙酸鈉投加量進行試驗，調試初期投加量較高時，TN 去除率達 40%～60%，經過調控，0.1g / L 的乙酸鈉投加濃度為最佳運行投加量。 合肥市某污水處理廠采用 AAO，通過調控投加甲醇 20 ～ 50mg/ L，能使出水 TN 控制 5 mg / L 以下。 碳源投加種類及投加量需要結合廠內處理水質及工藝進行調整。 多級AO+高效沉淀池+反硝化深床濾池工藝中進水 TN波動很大時，改在缺氧池投加葡萄糖和濾池前投加乙酸鈉，以此來避免出水 COD 和 BOD5 可能過高的現象， 并且碳源成本較低。 某污水處理廠以甲醇、乙酸鈉為碳源研究對反硝化生物濾池的影響，結果表明：乙酸鈉微生物產量高、運行周期短，濾池中與反硝化有關均屬占 58 38%， 高于投加甲醇濾池的 36 68%，但甲醇運行穩定、成本較低。
2、氧氣含量
反硝化反應過程中以硝酸鹽代替分子氧作為電子受體，進行無氧呼吸分解有機質。 反硝化深床濾池的濾料層附著的脫氮微生物在缺氧環境下將水中的硝酸鹽氮還原成氮氣。 當反硝化深床濾池構筑物環境中氧氣含量高時，反硝化菌會以氧為電子受體，優先消耗氧氣，或降低對硝酸鹽氮的消耗，影響脫氮效率。 研究表明， 系統中溶解氧保持在 0 5 mg / L時，反硝化才能正常進行。 出水溶解氧大于 5 mg / L 時，TN 去除率小于 20%，而出水溶解氧小于 1 mg / L 時，TN 去除率達到 60% ～ 80%。 溶解氧過高會增加外加碳源的投加量， 不利于反硝化作用。 因此，在反硝化深床濾池運行管理中需要控制溶解氧含量，而在水頭跌落中充氧，有工程采用恒水位過濾或弧形堰進水等技術進行改進。
3、環境溫度
反硝化菌適宜環境溫度一般為 30 ℃ ，低于 5 ℃時反硝化反應幾乎停止。 因此，在低溫( 如冬季) 運行時，反硝化脫氮效率會受到影響，如上海冬季溫度基本上在 10 ℃ 左右，反硝化作用效率較低，深床濾池反硝化生物膜馴化周期延長。 夏季運行 TN 能達標時，反硝化深床濾池不投加碳源，作為普通濾池使用，過濾水中懸浮顆粒。 冬季運行時， 投加合適碳源，深床濾料上的生物膜消耗碳源，生長迅速，逐漸富集反硝化菌群，對二級出水進行反硝化脫氮，保障TN 達標。 潁南污水處理廠冬季運行時計算得出：去除 1 mg TN 需乙酸鈉 9 3 mg，需 BOD5 4 82 mg，高于理論值[ 2 86 g BOD / ( g 硝態氮) ] 。